1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 0000-0001-6601-2184 Khayat, R. 0009-0000-6951-4526 Madoo, K. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C6 H15 N4 O2 1 175.209 y ARGININE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking C3 H7 N O2 S 121.158 y CYSTEINE L-peptide linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 S 149.211 y METHIONINE L-peptide linking C9 H11 N O2 165.189 y PHENYLALANINE L-peptide linking C5 H9 N O2 115.130 y PROLINE L-peptide linking C3 H7 N O3 105.093 y SERINE L-peptide linking C4 H9 N O3 119.119 y THREONINE L-peptide linking C11 H12 N2 O2 204.225 y TRYPTOPHAN L-peptide linking C9 H11 N O3 181.189 y TYROSINE L-peptide linking C4 H9 N O2 103.120 UNKNOWN L-peptide linking C5 H11 N O2 117.146 y VALINE L-peptide linking N 1 N N N 2 S C N 3 N C N 4 N O N 5 N C N 6 N O N 7 N H N 8 N H N 9 N H N 10 N H N 11 N H N 12 N H N 13 N H N 14 N N N 15 S C N 16 N C N 17 N O N 18 N C N 19 N C N 20 N C N 21 N N N 22 N C N 23 N N N 24 N N N 25 N O N 26 N H N 27 N H N 28 N H N 29 N H N 30 N H N 31 N H N 32 N H N 33 N H N 34 N H N 35 N H N 36 N H N 37 N H N 38 N H N 39 N H N 40 N H N 41 N N N 42 S C N 43 N C N 44 N O N 45 N C N 46 N C N 47 N O N 48 N N N 49 N O N 50 N H N 51 N H N 52 N H N 53 N H N 54 N H N 55 N H N 56 N H N 57 N H N 58 N N N 59 S C N 60 N C N 61 N O N 62 N C N 63 N C N 64 N O N 65 N O N 66 N O N 67 N H N 68 N H N 69 N H N 70 N H N 71 N H N 72 N H N 73 N H N 74 N N N 75 R C N 76 N C N 77 N O N 78 N C N 79 N S N 80 N O N 81 N H N 82 N H N 83 N H N 84 N H N 85 N H N 86 N H N 87 N H N 88 N N N 89 S C N 90 N C N 91 N O N 92 N C N 93 N C N 94 N C N 95 N O N 96 N N N 97 N O N 98 N H N 99 N H N 100 N H N 101 N H N 102 N H N 103 N H N 104 N H N 105 N H N 106 N H N 107 N H N 108 N N N 109 S C N 110 N C N 111 N O N 112 N C N 113 N C N 114 N C N 115 N O N 116 N O N 117 N O N 118 N H N 119 N H N 120 N H N 121 N H N 122 N H N 123 N H N 124 N H N 125 N H N 126 N H N 127 N N N 128 N C N 129 N C N 130 N O N 131 N O N 132 N H N 133 N H N 134 N H N 135 N H N 136 N H N 137 N N N 138 S C N 139 N C N 140 N O N 141 N C Y 142 N C Y 143 N N Y 144 N C Y 145 N C Y 146 N N N 147 N O N 148 N H N 149 N H N 150 N H N 151 N H N 152 N H N 153 N H N 154 N H N 155 N H N 156 N H N 157 N H N 158 N N N 159 S C N 160 N C N 161 N O N 162 S C N 163 N C N 164 N C N 165 N C N 166 N O N 167 N H N 168 N H N 169 N H N 170 N H N 171 N H N 172 N H N 173 N H N 174 N H N 175 N H N 176 N H N 177 N H N 178 N H N 179 N H N 180 N N N 181 S C N 182 N C N 183 N O N 184 N C N 185 N C N 186 N C N 187 N C N 188 N O N 189 N H N 190 N H N 191 N H N 192 N H N 193 N H N 194 N H N 195 N H N 196 N H N 197 N H N 198 N H N 199 N H N 200 N H N 201 N H N 202 N N N 203 S C N 204 N C N 205 N O N 206 N C N 207 N C N 208 N C N 209 N C N 210 N N N 211 N O N 212 N H N 213 N H N 214 N H N 215 N H N 216 N H N 217 N H N 218 N H N 219 N H N 220 N H N 221 N H N 222 N H N 223 N H N 224 N H N 225 N H N 226 N H N 227 N N N 228 S C N 229 N C N 230 N O N 231 N C N 232 N C N 233 N S N 234 N C N 235 N O N 236 N H N 237 N H N 238 N H N 239 N H N 240 N H N 241 N H N 242 N H N 243 N H N 244 N H N 245 N H N 246 N H N 247 N N N 248 S C N 249 N C N 250 N O N 251 N C Y 252 N C Y 253 N C Y 254 N C Y 255 N C Y 256 N C Y 257 N C N 258 N O N 259 N H N 260 N H N 261 N H N 262 N H N 263 N H N 264 N H N 265 N H N 266 N H N 267 N H N 268 N H N 269 N H N 270 N N N 271 S C N 272 N C N 273 N O N 274 N C N 275 N C N 276 N C N 277 N O N 278 N H N 279 N H N 280 N H N 281 N H N 282 N H N 283 N H N 284 N H N 285 N H N 286 N H N 287 N N N 288 S C N 289 N C N 290 N O N 291 N C N 292 N O N 293 N O N 294 N H N 295 N H N 296 N H N 297 N H N 298 N H N 299 N H N 300 N H N 301 N N N 302 S C N 303 N C N 304 N O N 305 R C N 306 N O N 307 N C N 308 N O N 309 N H N 310 N H N 311 N H N 312 N H N 313 N H N 314 N H N 315 N H N 316 N H N 317 N H N 318 N N N 319 S C N 320 N C N 321 N O N 322 N C Y 323 N C Y 324 N C Y 325 N C Y 326 N N Y 327 N C Y 328 N C Y 329 N C Y 330 N C Y 331 N C N 332 N O N 333 N H N 334 N H N 335 N H N 336 N H N 337 N H N 338 N H N 339 N H N 340 N H N 341 N H N 342 N H N 343 N H N 344 N H N 345 N N N 346 S C N 347 N C N 348 N O N 349 N C Y 350 N C Y 351 N C Y 352 N C Y 353 N C Y 354 N C Y 355 N C N 356 N O N 357 N O N 358 N H N 359 N H N 360 N H N 361 N H N 362 N H N 363 N H N 364 N H N 365 N H N 366 N H N 367 N H N 368 N H N 369 N N N 370 S C N 371 N C N 372 N O N 373 N C N 374 N C N 375 N C N 376 N O N 377 N H N 378 N H N 379 N H N 380 N H N 381 N H N 382 N H N 383 N H N 384 N H N 385 N H N 386 N H N 387 N H N 1 N sing N 2 N sing N 3 N sing N 4 N sing N 5 N sing N 6 N sing N 7 N doub N 8 N sing N 9 N sing N 10 N sing N 11 N sing N 12 N sing N 13 N sing N 14 N sing N 15 N sing N 16 N sing N 17 N sing N 18 N sing N 19 N doub N 20 N sing N 21 N sing N 22 N sing N 23 N sing N 24 N sing N 25 N sing N 26 N sing N 27 N sing N 28 N sing N 29 N sing N 30 N sing N 31 N sing N 32 N sing N 33 N doub N 34 N sing N 35 N sing N 36 N sing N 37 N sing N 38 N sing N 39 N sing N 40 N sing N 41 N sing N 42 N sing N 43 N sing N 44 N sing N 45 N doub N 46 N sing N 47 N sing N 48 N sing N 49 N sing N 50 N doub N 51 N sing N 52 N sing N 53 N sing N 54 N sing N 55 N sing N 56 N sing N 57 N sing N 58 N sing N 59 N sing N 60 N sing N 61 N doub N 62 N sing N 63 N sing N 64 N sing N 65 N sing N 66 N doub N 67 N sing N 68 N sing N 69 N sing N 70 N sing N 71 N sing N 72 N sing N 73 N sing N 74 N sing N 75 N sing N 76 N doub N 77 N sing N 78 N sing N 79 N sing N 80 N sing N 81 N sing N 82 N sing N 83 N sing N 84 N sing N 85 N sing N 86 N sing N 87 N sing N 88 N sing N 89 N doub N 90 N sing N 91 N sing N 92 N sing N 93 N sing N 94 N sing N 95 N sing N 96 N sing N 97 N doub N 98 N sing N 99 N sing N 100 N sing N 101 N sing N 102 N sing N 103 N sing N 104 N sing N 105 N sing N 106 N sing N 107 N sing N 108 N doub N 109 N sing N 110 N sing N 111 N sing N 112 N sing N 113 N sing N 114 N sing N 115 N sing N 116 N doub N 117 N sing N 118 N sing N 119 N sing N 120 N sing N 121 N sing N 122 N sing N 123 N sing N 124 N sing N 125 N sing N 126 N doub N 127 N sing N 128 N sing N 129 N sing N 130 N sing N 131 N sing N 132 N sing N 133 N sing N 134 N sing N 135 N doub N 136 N sing N 137 N sing N 138 N sing N 139 N sing Y 140 N sing Y 141 N doub Y 142 N doub N 143 N sing Y 144 N sing N 145 N sing Y 146 N sing N 147 N sing N 148 N sing N 149 N sing N 150 N sing N 151 N sing N 152 N sing N 153 N sing N 154 N sing N 155 N sing N 156 N doub N 157 N sing N 158 N sing N 159 N sing N 160 N sing N 161 N sing N 162 N sing N 163 N sing N 164 N sing N 165 N sing N 166 N sing N 167 N sing N 168 N sing N 169 N sing N 170 N sing N 171 N sing N 172 N sing N 173 N sing N 174 N sing N 175 N sing N 176 N sing N 177 N doub N 178 N sing N 179 N sing N 180 N sing N 181 N sing N 182 N sing N 183 N sing N 184 N sing N 185 N sing N 186 N sing N 187 N sing N 188 N sing N 189 N sing N 190 N sing N 191 N sing N 192 N sing N 193 N sing N 194 N sing N 195 N sing N 196 N sing N 197 N sing N 198 N doub N 199 N sing N 200 N sing N 201 N sing N 202 N sing N 203 N sing N 204 N sing N 205 N sing N 206 N sing N 207 N sing N 208 N sing N 209 N sing N 210 N sing N 211 N sing N 212 N sing N 213 N sing N 214 N sing N 215 N sing N 216 N sing N 217 N sing N 218 N sing N 219 N sing N 220 N sing N 221 N sing N 222 N doub N 223 N sing N 224 N sing N 225 N sing N 226 N sing N 227 N sing N 228 N sing N 229 N sing N 230 N sing N 231 N sing N 232 N sing N 233 N sing N 234 N sing N 235 N sing N 236 N sing N 237 N sing N 238 N sing N 239 N sing N 240 N sing N 241 N doub N 242 N sing N 243 N sing N 244 N sing N 245 N sing Y 246 N doub Y 247 N sing Y 248 N sing N 249 N sing Y 250 N doub N 251 N sing Y 252 N doub N 253 N sing Y 254 N sing N 255 N sing N 256 N sing N 257 N sing N 258 N sing N 259 N sing N 260 N sing N 261 N sing N 262 N sing N 263 N sing N 264 N doub N 265 N sing N 266 N sing N 267 N sing N 268 N sing N 269 N sing N 270 N sing N 271 N sing N 272 N sing N 273 N sing N 274 N sing N 275 N sing N 276 N sing N 277 N sing N 278 N sing N 279 N sing N 280 N sing N 281 N doub N 282 N sing N 283 N sing N 284 N sing N 285 N sing N 286 N sing N 287 N sing N 288 N sing N 289 N sing N 290 N sing N 291 N sing N 292 N sing N 293 N sing N 294 N doub N 295 N sing N 296 N sing N 297 N sing N 298 N sing N 299 N sing N 300 N sing N 301 N sing N 302 N sing N 303 N sing N 304 N sing N 305 N sing N 306 N sing N 307 N sing N 308 N sing N 309 N sing N 310 N doub N 311 N sing N 312 N sing N 313 N sing N 314 N sing Y 315 N doub Y 316 N sing Y 317 N sing N 318 N sing Y 319 N doub Y 320 N sing Y 321 N sing N 322 N sing Y 323 N sing Y 324 N doub N 325 N sing Y 326 N doub N 327 N sing Y 328 N sing N 329 N sing N 330 N sing N 331 N sing N 332 N sing N 333 N sing N 334 N sing N 335 N sing N 336 N sing N 337 N sing N 338 N doub N 339 N sing N 340 N sing N 341 N sing N 342 N sing Y 343 N doub Y 344 N sing Y 345 N sing N 346 N sing Y 347 N doub N 348 N sing Y 349 N doub N 350 N sing Y 351 N sing N 352 N sing N 353 N sing N 354 N sing N 355 N sing N 356 N sing N 357 N sing N 358 N sing N 359 N sing N 360 N sing N 361 N sing N 362 N doub N 363 N sing N 364 N sing N 365 N sing N 366 N sing N 367 N sing N 368 N sing N 369 N sing N 370 N sing N 371 N sing N 372 N sing N 373 N sing US Proc.Natl.Acad.Sci.USA PNASA6 0040 1091-6490 123 e2526969123 e2526969123 10.1073/pnas.2526969123 42301791 Structure of Human adenovirus 7 virus-like particles, a platform for developing nanotherapeutics and studying capsid assembly. 2026 0009-0005-4377-2830 0000-0002-6527-8658 0000-0002-1963-2732 0000-0002-9678-4529 0000-0002-4661-509X 0000-0001-6601-2184 10.2210/pdb9yd0/pdb pdb_00009yd0 Residues SER R 56 and PRO R 57 that are next to each other in the sample sequence are not properly linked: distance between C and N is 2.06 A. Physically unrealistic interatomic distance: ALA R 65 CB - ALA R 69 CB Dist = 0.87 A. phenix.real_space_refine 1.19.2_4158 FLEXIBLE FIT REAL Cross-correlation coefficient AlphaFold in silico model 9YD0 360841 3.8 FSC 0.143 CUT-OFF POINT REL 2025-09-20 RCSB 2026-07-01 2026-07-01 Structure of the Adenovirus-7 VLP, Class 1 7.4 1 PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION Adenovirus 7 Virus-like particles 1,2,3,4,5 Adenovirus 7 Virus-like particles 0 RECOMBINANT COMPLEX NO MEGADALTONS 18.2 10519 Human adenovirus 7 HEK-293 9606 Homo sapiens PARTICLE 1 1 SINGLE PARTICLE 50 53.35 Not all images had particles. GATAN K3 BIOCONTINUUM (6k x 4k) 1 13608 4092 5760 9YD0 300 COMA FREE 2500 81000 NITROGEN FIELD EMISSION GUN FLOOD BEAM TFS KRIOS BRIGHT FIELD 2.7 2600 500 81000 FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER 1 COPPER 400 Quantifoil Active R2/1 9YD0 C1 PARTICLE SELECTION Manual picking 1 cryoSPARC 4.13 IMAGE ACQUISITION 1 Leginon MASKING CTF CORRECTION 1 cryoSPARC 4.13 LAYERLINE INDEXING DIFFRACTION INDEXING MODEL FITTING Manually fitted as rigid body 1 UCSF Chimera 1.19 OTHER INITIAL EULER ASSIGNMENT 1 cryoSPARC 4.13 FINAL EULER ASSIGNMENT 1 RELION 4.0 CLASSIFICATION 1 RELION 4.0 RECONSTRUCTION 1 RELION 4.0 MODEL REFINEMENT Weight was placed on geometry 1 PHENIX 1.19 VOLUME SELECTION 1 1 1 SERIES ALIGNMENT 1 1 1 MOLECULAR REPLACEMENT 1 1 1 LATTICE DISTORTION CORRECTION 1 1 1 SYMMETRY DETERMINATION 1 1 1 CRYSTALLOGRAPHY MERGING 1 1 1 1 NO NO NO YES 277 ETHANE 9YD0 100 FEI VITROBOT MARK IV 27178.840 Pre-protein VI 8 man polymer 105807.125 Hexon protein 12 man polymer 65798.375 Pre-hexon-linking protein IIIa 1 man polymer Due to the low quality of map in certain regions, the identites of some of the amino acids in the model were left as unknown (UNK). 13125.939 Hexon-interlacing protein IX 4 man polymer 24902.814 Pre-hexon-linking protein VIII 2 man polymer pVI CP-H,Protein II Capsid vertex-specific component IIIa,CVSC,Protein IIIa,pIIIa Protein IX Pre-protein VIII,pVIII no no MEDINFSSLAPRHGTRPYMGTWSDIGTSQLNGGAFNWSSIWSGLKNFGSTVKTYGNKAWNSSTGQALRNKLKEQNFQQKV VDGIASGINGVVDLANQAVQKQINSRLDPPPATPGEMEVEEELPPLEKRGDKRPRPELEQTLVTRADEPPSYEEAVKLGM PTTRPVAHMATGVMKPSQSHRPATLDLPPPPASAALVPKPVATRKPTAVQPVAVARPRPGGTPRPKANWQSTLNSIVGLG VQSVKRRRCY MEDINFSSLAPRHGTRPYMGTWSDIGTSQLNGGAFNWSSIWSGLKNFGSTVKTYGNKAWNSSTGQALRNKLKEQNFQQKV VDGIASGINGVVDLANQAVQKQINSRLDPPPATPGEMEVEEELPPLEKRGDKRPRPELEQTLVTRADEPPSYEEAVKLGM PTTRPVAHMATGVMKPSQSHRPATLDLPPPPASAALVPKPVATRKPTAVQPVAVARPRPGGTPRPKANWQSTLNSIVGLG VQSVKRRRCY 0,1,2,3,4,W,Y,Z polypeptide(L) no no MATPSMMPQWAYMHIAGQDASEYLSPGLVQFARATDTYFSMGNKFRNPTVAPTHDVTTDRSQRLMLRFVPVDREDNTYSY KVRYTLAVGDNRVLDMASTFFDIRGVLDRGPSFKPYSGTAYNSLAPKGAPNTSQWIVTAGEERAVTTTTNTFGIASMKGD NITKEGLEIGKDITADNKPIYADKTYQPEPQVGEESWTDTDGTNEKFGGRALKPATKMKPCYGSFARPTNIKGGQAKNRK VKPTEGDVETEEPDIDMEFFDGREAADAFSPEIVLYTENVNLETPDSHVVYKPGTSDDNSHANLGQQAMPNRPNYIGFRD NFVGLMYYNSTGNMGVLAGQASQLNAVVDLQDRNTELSYQLLLDSLGDRTRYFSMWNQAVDSYDPDVRIIENHGIEDELP NYCFPLDGIGPAKTYQGIKSKDNGWEKDDNVSKSNEIAIGNNQAMEINIQANLWRSFLYSNVALYLPDVYKYTPTNITLP ANTNTYEYMNGRVVSPSLVDSYINIGARWSLDPMDNVNPFNHHRNAGLRYRSMLLGNGRYVPFHIQVPQKFFAVKNLLLL PGSYTYEWNFRKDVNMVLQSSLGNDLRTDGATISFTSINLYATFFPMAHNTASTLEAMLRNDTNDQSFNDYLSAANMLYP IPANATNIPISIPSRNWAAFRGWSFTRLKTKETPSLGSGFDPYFVYSGSIPYLDGTFYLNHTFKKVSIMFDSSVSWPGND RLLSPNEFEIKRTVDGEGYNVAQCNMTKDWFLVQMLANYNIGYQGFYIPEGYKDRMYSFFRNFQPMSRQVVDEVNYTDYK AVTLPYQHNNSGFVGYLAPTMRQGEPYPANYPYPLIGTTAVKSVTQKKFLCDRTMWRIPFSSNFMSMGALTDLGQNMLYA NSAHALDMTFEVDPMDEPTLLYLLFEVFDVVRVHQPHRGVIEAVYLRTPFSAGNATT MATPSMMPQWAYMHIAGQDASEYLSPGLVQFARATDTYFSMGNKFRNPTVAPTHDVTTDRSQRLMLRFVPVDREDNTYSY KVRYTLAVGDNRVLDMASTFFDIRGVLDRGPSFKPYSGTAYNSLAPKGAPNTSQWIVTAGEERAVTTTTNTFGIASMKGD NITKEGLEIGKDITADNKPIYADKTYQPEPQVGEESWTDTDGTNEKFGGRALKPATKMKPCYGSFARPTNIKGGQAKNRK VKPTEGDVETEEPDIDMEFFDGREAADAFSPEIVLYTENVNLETPDSHVVYKPGTSDDNSHANLGQQAMPNRPNYIGFRD NFVGLMYYNSTGNMGVLAGQASQLNAVVDLQDRNTELSYQLLLDSLGDRTRYFSMWNQAVDSYDPDVRIIENHGIEDELP NYCFPLDGIGPAKTYQGIKSKDNGWEKDDNVSKSNEIAIGNNQAMEINIQANLWRSFLYSNVALYLPDVYKYTPTNITLP ANTNTYEYMNGRVVSPSLVDSYINIGARWSLDPMDNVNPFNHHRNAGLRYRSMLLGNGRYVPFHIQVPQKFFAVKNLLLL PGSYTYEWNFRKDVNMVLQSSLGNDLRTDGATISFTSINLYATFFPMAHNTASTLEAMLRNDTNDQSFNDYLSAANMLYP IPANATNIPISIPSRNWAAFRGWSFTRLKTKETPSLGSGFDPYFVYSGSIPYLDGTFYLNHTFKKVSIMFDSSVSWPGND RLLSPNEFEIKRTVDGEGYNVAQCNMTKDWFLVQMLANYNIGYQGFYIPEGYKDRMYSFFRNFQPMSRQVVDEVNYTDYK AVTLPYQHNNSGFVGYLAPTMRQGEPYPANYPYPLIGTTAVKSVTQKKFLCDRTMWRIPFSSNFMSMGALTDLGQNMLYA NSAHALDMTFEVDPMDEPTLLYLLFEVFDVVRVHQPHRGVIEAVYLRTPFSAGNATT A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L polypeptide(L) no no MEQQQAPDPAMRAALQSQPSGINSSDDWTQAMQRIMALTTRNPEAFRQQPQANRLSAILEAVVPSRSNPTHEKVLAIVNA LVENKAIRPDEAGLVYNALLERVARYNSSNVQTNLDRMVTDVREAVSQRERFQRDANLGSLVALNAFLSTQPANVPRGQQ DYTNFLSALRLMVAEVPQSEVYQSGPDYFFQTSRQGLQTVNLTQAFKNLKGLWGVHAPVGDRATVSSLLTPNSRLLLLLV SPFTDSGSIDRNSYLGYLLNLYREAIGQSQVDEQTYQEITQVSRALGQEDTGSLEATLNFLLTNRSQKIPPQYALTAEEE RILRYVQQSVGLFLMQEGATPTAALDMTARNMEPSMYASNRPFINKLLDYLHRAAAMNSDYFTNAILNPHWLPPPGFYTG EYDMPDPNDGFLWDDVDSSIFSPPPGYTVWKKEGGDTRHSSVSLSRTAGAAATVPEAASPFPSLPFSLNSVRSSELGRIT RPRLMGEDEYLNDSLLRPEREKNFPNNGIESLVDKMSRWKTYAQDHRDEPKILGATSRPTRRRQRHDRQMGLVWDDEDSA DDSSVLDLGGRGGGNPFAHLRPRFGRML MEQQQAPDPAMRAALQSQPSGINSSDDWTQAMQRIMALTTRNPEAFRQQPQANRLSAILEAVVPSRSNPTHEKVLAIVNA LVENKAIRPDEAGLVYNALLERVARYNSSNVQTNLDRMVTDVREAVSQRERFQRDANLGSLVALNAFLSTQPANVPRGQQ DYTNFLSALRLMVAEVPQSEVYQSGPDYFFQTSRQGLQTVNLTQAFKNLKGLWGVHAPVGDRATVSSLLTPNSRLLLLLV SPFTDSGSIDRNSYLGYLLNLYREAIGQSQVDEQTYQEITQVSRALGQEDTGSLEATLNFLLTNRSQKIPPQYALTAEEE RILRYVQQSVGLFLMQEGATPTAALDMTARNMEPSMYASNRPFINKLLDYLHRAAAMNSDYFTNAILNPHWLPPPGFYTG 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MSKEIPTPYMWSYQPQMGLAAGASQDYSTRMNWLSAGPSMISRVNDIRAYRNQLLLEQSALTTTPRQHLNPRNWPAALVY QETPAPTTVLLPRDAQAEVHMTNAGVQLAGGSALCRHRPQQSIKRLVIRGRGIQLNDESVSSSLGLRPDGVFQIAGCGRS SFTPRQAVLTLESSSSQPRSGGIGTLQFVEEFTPSVYFNPFSGSPGQYPDEFIPNFDAISESVDGYD U,V polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n sample 1 250 L3 10519 Human adenovirus 7 CRL-1473 HEK-293 9606 Homo sapiens Biological sequence sample 1 937 L3 10519 Human adenovirus 7 9606 Homo sapiens Biological sequence sample 1 588 L1 10519 Human adenovirus 7 9606 Homo sapiens Biological sequence sample 1 138 IX 10519 Human adenovirus 7 9606 Homo sapiens Biological sequence sample 1 227 L4 10519 Human adenovirus 7 9606 Homo sapiens Biological sequence repository Initial release repository Initial release 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Class 2 Class 3 Class 4 VLP PB-Fiber N RCSB N RCSB 2025-09-20 REL N Many residues of chains P, Q, R, and S, comprised of entity 4 (Protein IX) were not identified, and modeled as UNK. The actual sequence is: MSGSASFEGGVFSPYLTGRLPPWAGVRQNVMGSTVDGRPVQPANSSTLTYATLSSSPLDAAAAAAATAAANTILGMGYYG SIVANSSSSNNPSTLAEDKLLVLLAQLEALTQRLGELSKQVAQLREQTESAVATAKSK AlphaFold in silico model n 1 1 0 n 2 2 0 n 3 3 0 n 4 4 0 ASN 5 n 5 ASN 5 0 PHE 6 n 6 PHE 6 0 SER 7 n 7 SER 7 0 SER 8 n 8 SER 8 0 LEU 9 n 9 LEU 9 0 ALA 10 n 10 ALA 10 0 PRO 11 n 11 PRO 11 0 ARG 12 n 12 ARG 12 0 HIS 13 n 13 HIS 13 0 n 14 14 0 n 15 15 0 n 16 16 0 n 17 17 0 n 18 18 0 n 19 19 0 n 20 20 0 n 21 21 0 n 22 22 0 n 23 23 0 n 24 24 0 n 25 25 0 n 26 26 0 THR 27 n 27 THR 27 0 SER 28 n 28 SER 28 0 GLN 29 n 29 GLN 29 0 LEU 30 n 30 LEU 30 0 ASN 31 n 31 ASN 31 0 GLY 32 n 32 GLY 32 0 GLY 33 n 33 GLY 33 0 n 34 34 0 n 35 35 0 n 36 36 0 n 37 37 0 n 38 38 0 n 39 39 0 n 40 40 0 n 41 41 0 n 42 42 0 n 43 43 0 n 44 44 0 n 45 45 0 n 46 46 0 n 47 47 0 n 48 48 0 n 49 49 0 n 50 50 0 n 51 51 0 n 52 52 0 n 53 53 0 n 54 54 0 n 55 55 0 n 56 56 0 n 57 57 0 n 58 58 0 n 59 59 0 n 60 60 0 n 61 61 0 n 62 62 0 n 63 63 0 n 64 64 0 n 65 65 0 n 66 66 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-163.71 113.07 1 1 ASP 24 -143.58 29.04 1 2 THR 15 -96.56 58.03 1 2 TRP 22 -104.66 42.60 1 2 SER 23 -94.33 -75.07 1 4 ASP 24 77.70 154.87 1 4 THR 27 73.45 135.44 1 4 LEU 30 74.21 -85.49 1 A THR 35 -92.75 49.24 1 A LYS 44 -142.46 27.10 1 A ALA 139 -161.87 -169.43 1 A GLU 141 64.45 -178.84 1 A GLU 142 59.31 -154.24 1 A GLN 187 -68.51 -179.27 1 A PRO 188 32.59 62.93 1 A SER 196 -171.28 147.76 1 A THR 203 68.98 -66.29 1 A VAL 241 38.18 -109.63 1 A THR 250 53.42 -96.41 1 A GLU 264 47.64 -133.28 1 A ALA 265 59.82 -79.48 1 A LYS 292 55.19 80.28 1 A ARG 312 34.45 73.41 1 A ASP 320 -63.99 -73.86 1 A ASN 321 -99.61 48.60 1 A ALA 341 61.71 81.39 1 A SER 342 73.82 67.79 1 A LEU 366 -92.02 55.22 1 A MET 375 156.06 -66.46 1 A ILE 409 -124.03 -61.04 1 A ILE 418 67.93 144.18 1 A ASP 422 69.50 -142.63 1 A GLU 436 -90.04 57.79 1 A ALA 463 -133.56 -40.79 1 A ALA 591 -174.13 148.73 1 A SER 687 -140.07 45.45 1 A THR 702 -98.33 57.05 1 A ASP 711 -67.85 76.39 1 A SER 712 58.90 16.63 1 A LEU 722 66.79 167.56 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-94.37 48.81 1 B ASN 809 87.21 123.74 1 B PRO 832 30.53 93.16 1 B PRO 859 -67.66 -179.13 1 B GLN 875 -143.43 -9.28 1 B HIS 917 63.00 -172.61 1 C LYS 44 -142.00 31.46 1 C THR 53 -102.17 -60.12 1 C TYR 78 -142.39 20.38 1 C GLU 142 63.85 -133.20 1 C GLU 165 -142.00 30.67 1 C ALA 175 -96.18 -72.91 1 C ASP 176 -166.17 99.53 1 C PRO 188 31.09 62.90 1 C THR 250 60.51 177.74 1 C ALA 265 103.98 -140.40 1 C ALA 266 -77.11 -168.91 1 C ASP 267 97.94 -89.94 1 C ASP 298 58.72 -173.15 1 C ARG 312 60.75 75.73 1 C ARG 319 -78.16 -162.43 1 C ASP 320 -70.50 -150.68 1 C ASN 321 -65.63 73.27 1 C PHE 322 39.79 53.29 1 C ASP 397 -90.31 -60.81 1 C GLU 398 59.45 -71.40 1 C ASP 422 57.61 -123.94 1 C ALA 444 -172.00 147.15 1 C ASN 624 -95.61 30.83 1 C LEU 676 -78.47 -167.69 1 C TYR 686 -170.33 144.52 1 C TYR 698 -142.23 17.88 1 C ASP 711 -66.81 78.90 1 C SER 712 74.74 -7.62 1 C ASN 719 -78.37 -164.81 1 C LEU 722 72.89 174.11 1 C VAL 741 -98.42 -68.44 1 C ASN 745 -94.79 55.50 1 C TYR 759 -125.89 -165.00 1 C ASP 798 -92.64 54.79 1 C PRO 832 20.30 93.45 1 C THR 854 178.55 174.10 1 C ASN 881 -140.24 17.14 1 D GLU 22 -141.27 26.09 1 D THR 35 -90.42 58.87 1 D TYR 78 -140.70 28.01 1 D ASN 131 -83.72 -72.22 1 D THR 132 -172.76 125.73 1 D MET 157 -164.63 110.60 1 D ASP 172 62.57 61.37 1 D THR 174 -131.02 -40.53 1 D PRO 188 21.64 59.52 1 D ASN 230 -172.69 148.16 1 D LYS 232 -99.90 32.13 1 D GLU 249 72.97 -9.97 1 D THR 250 55.44 16.84 1 D ASP 267 -171.64 148.01 1 D THR 295 34.79 -157.89 1 D ARG 312 56.00 81.70 1 D ARG 319 -79.45 -162.10 1 D ASP 320 -74.11 -157.07 1 D TYR 327 -67.56 99.92 1 D ASP 422 59.55 -99.66 1 D SER 501 -64.72 5.26 1 D ASN 516 -99.25 31.86 1 D ASP 589 -91.99 52.17 1 D ASN 624 -94.26 51.04 1 D TYR 686 -170.28 144.77 1 D ASP 711 -37.38 131.60 1 D SER 713 145.64 -66.70 1 D LEU 722 69.78 171.01 1 D ASN 881 -109.92 78.94 1 D ARG 918 46.24 120.45 1 E THR 35 -90.88 58.54 1 E LYS 114 -159.14 88.67 1 E GLU 142 63.93 -70.73 1 E PHE 152 -162.18 117.56 1 E PRO 188 8.86 77.00 1 E GLN 235 -140.67 41.60 1 E GLU 245 42.62 -165.66 1 E VAL 248 178.95 -116.72 1 E THR 250 61.80 -67.77 1 E ASP 267 -132.12 -38.05 1 E LEU 325 -67.24 0.69 1 E ASN 329 -95.27 56.52 1 E ASN 333 -96.21 58.91 1 E SER 342 -79.90 -168.63 1 E GLU 396 -96.42 59.28 1 E ASP 422 56.32 -97.84 1 E ALA 463 -132.75 -39.87 1 E VAL 493 67.46 139.31 1 E ALA 591 -171.72 143.33 1 E PRO 653 -68.56 -179.89 1 E ALA 659 -142.15 31.59 1 E ASP 681 57.83 71.14 1 E TYR 683 -94.86 33.66 1 E TYR 686 -165.65 117.12 1 E THR 696 -100.28 76.85 1 E TYR 698 -142.33 12.76 1 E ASP 711 -66.67 74.99 1 E LEU 722 68.78 165.44 1 E VAL 794 -101.97 -60.40 1 E ARG 853 -143.88 25.70 1 E ASN 863 -67.95 -82.66 1 E PHE 864 -150.12 19.29 1 E ALA 932 -125.06 -169.86 1 F ALA 11 164.55 -44.92 1 F LYS 44 -140.55 30.35 1 F SER 112 -96.28 35.67 1 F ASN 131 -82.57 -79.42 1 F THR 132 -154.35 31.99 1 F GLU 142 62.82 -160.40 1 F ALA 144 -90.81 55.76 1 F PRO 188 36.42 63.85 1 F THR 200 53.45 -106.38 1 F GLU 205 47.58 -152.91 1 F THR 244 56.16 14.33 1 F VAL 248 46.92 -159.81 1 F SER 296 60.69 75.03 1 F ASN 299 -35.41 129.66 1 F ARG 312 56.49 81.96 1 F ASN 329 -97.50 52.27 1 F SER 342 87.95 156.95 1 F ASP 352 -98.21 34.87 1 F ARG 369 -92.68 56.62 1 F ASP 422 62.41 -133.07 1 F ASN 423 -96.06 49.83 1 F ASN 430 -91.15 48.86 1 F ILE 439 67.76 -73.68 1 F ASP 500 -102.55 -169.99 1 F MET 514 -95.00 58.40 1 F ASN 516 -92.10 59.94 1 F ASN 518 58.96 74.82 1 F TYR 540 60.73 65.38 1 F LYS 555 -143.91 -3.31 1 F PRO 606 -69.98 65.77 1 F PHE 710 -96.43 -61.90 1 F SER 712 73.68 -5.91 1 F SER 713 -131.93 -32.20 1 F LEU 722 82.57 150.26 1 F ALA 742 62.27 -140.20 1 F ASN 760 -92.66 33.25 1 F THR 797 74.12 -3.56 1 F ASN 810 36.49 56.51 1 F THR 820 -78.62 -164.50 1 F GLN 823 60.94 66.26 1 F ASN 830 -140.97 16.41 1 F PRO 832 32.30 99.23 1 F PHE 864 -89.46 47.50 1 F ARG 918 39.81 64.41 1 F LEU 926 -160.70 116.00 1 G GLU 142 65.13 -129.91 1 G ALA 175 -78.90 -169.53 1 G PRO 188 34.82 66.20 1 G LYS 232 -95.58 33.67 1 G GLN 235 -163.61 114.34 1 G PRO 243 -67.90 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