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Schwieters, C.D. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic 90.00 90.00 90.00 1.000 1.000 1.000 C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 S 149.211 y METHIONINE L-peptide linking C9 H11 N O2 165.189 y PHENYLALANINE L-peptide linking C5 H9 N O2 115.130 y PROLINE L-peptide linking C3 H7 N O3 105.093 y SERINE L-peptide linking C4 H9 N O3 119.119 y THREONINE L-peptide linking C9 H11 N O3 181.189 y TYROSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 117.146 y VALINE L-peptide linking N 1 N N N 2 S C N 3 N C N 4 N O N 5 N C N 6 N O 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N C N 217 N O N 218 N H N 219 N H N 220 N H N 221 N H N 222 N H N 223 N H N 224 N H N 225 N H N 226 N H N 227 N H N 228 N H N 229 N N N 230 S C N 231 N C N 232 N O N 233 N C N 234 N C N 235 N C N 236 N O N 237 N H N 238 N H N 239 N H N 240 N H N 241 N H N 242 N H N 243 N H N 244 N H N 245 N H N 246 N N N 247 S C N 248 N C N 249 N O N 250 N C N 251 N O N 252 N O N 253 N H N 254 N H N 255 N H N 256 N H N 257 N H N 258 N H N 259 N H N 260 N N N 261 S C N 262 N C N 263 N O N 264 R C N 265 N O N 266 N C N 267 N O N 268 N H N 269 N H N 270 N H N 271 N H N 272 N H N 273 N H N 274 N H N 275 N H N 276 N H N 277 N N N 278 S C N 279 N C N 280 N O N 281 N C Y 282 N C Y 283 N C Y 284 N C Y 285 N C Y 286 N C Y 287 N C N 288 N O N 289 N O N 290 N H N 291 N H N 292 N H N 293 N H N 294 N H N 295 N H N 296 N H N 297 N H N 298 N H N 299 N H N 300 N H N 301 N N N 302 S C N 303 N C N 304 N O N 305 N C N 306 N C N 307 N C N 308 N O N 309 N H N 310 N H N 311 N H N 312 N H N 313 N H N 314 N H N 315 N H N 316 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82 N sing N 83 N sing N 84 N sing N 85 N sing N 86 N sing N 87 N doub N 88 N sing N 89 N sing N 90 N sing N 91 N sing N 92 N sing N 93 N sing N 94 N sing N 95 N sing N 96 N doub N 97 N sing N 98 N sing N 99 N sing N 100 N sing Y 101 N sing Y 102 N doub Y 103 N doub N 104 N sing Y 105 N sing N 106 N sing Y 107 N sing N 108 N sing N 109 N sing N 110 N sing N 111 N sing N 112 N sing N 113 N sing N 114 N sing N 115 N sing N 116 N sing N 117 N doub N 118 N sing N 119 N sing N 120 N sing N 121 N sing N 122 N sing N 123 N sing N 124 N sing N 125 N sing N 126 N sing N 127 N sing N 128 N sing N 129 N sing N 130 N sing N 131 N sing N 132 N sing N 133 N sing N 134 N sing N 135 N sing N 136 N sing N 137 N sing N 138 N doub N 139 N sing N 140 N sing N 141 N sing N 142 N sing N 143 N sing N 144 N sing N 145 N sing N 146 N sing N 147 N sing N 148 N sing N 149 N sing N 150 N sing N 151 N sing N 152 N sing N 153 N sing N 154 N sing N 155 N sing N 156 N sing N 157 N sing N 158 N sing N 159 N doub N 160 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N sing N 238 N sing N 239 N sing N 240 N sing N 241 N sing N 242 N doub N 243 N sing N 244 N sing N 245 N sing N 246 N sing N 247 N sing N 248 N sing N 249 N sing N 250 N sing N 251 N sing N 252 N sing N 253 N sing N 254 N sing N 255 N doub N 256 N sing N 257 N sing N 258 N sing N 259 N sing N 260 N sing N 261 N sing N 262 N sing N 263 N sing N 264 N sing N 265 N sing N 266 N sing N 267 N sing N 268 N sing N 269 N sing N 270 N sing N 271 N doub N 272 N sing N 273 N sing N 274 N sing N 275 N sing Y 276 N doub Y 277 N sing Y 278 N sing N 279 N sing Y 280 N doub N 281 N sing Y 282 N doub N 283 N sing Y 284 N sing N 285 N sing N 286 N sing N 287 N sing N 288 N sing N 289 N sing N 290 N sing N 291 N sing N 292 N sing N 293 N sing N 294 N sing N 295 N doub N 296 N sing N 297 N sing N 298 N sing N 299 N sing N 300 N sing N 301 N sing N 302 N sing N 303 N sing N 304 N sing N 305 N sing N 306 N sing UK Nat Commun 2041-1723 15 2750 2750 10.1038/s41467-024-46832-5 38553463 Structure of alpha-synuclein fibrils derived from human Lewy body dementia tissue. 2024 0000-0002-0096-1085 0000-0002-5492-1847 0000-0001-5170-2000 0000-0002-3443-7716 0000-0003-3263-8917 0000-0002-1968-441X 0000-0002-7907-3602 0000-0001-8434-1010 0000-0002-9912-5596 10.2210/pdb8fpt/pdb pdb_00008fpt 10.13018/BMR31068 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 14476.108 Alpha-synuclein 10 man polymer Non-A beta component of AD amyloid,Non-A4 component of amyloid precursor,NACP no no MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAGKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVATVAEKTKEQVTNVGGAVVTGVTAVAQK TVEGAGSIAAATGFVKKDQLGKNEEGAPQEGILEDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA MDVFMKGLSKAKEGVVAAAEKTKQGVAEAAGKTKEGVLYVGSKTKEGVVHGVATVAEKTKEQVTNVGGAVVTGVTAVAQK TVEGAGSIAAATGFVKKDQLGKNEEGAPQEGILEDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA A,B,C,D,E,F,G,H,I,J polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n human sample 1 140 SNCA, NACP, PARK1 9606 Homo sapiens 469008 Escherichia coli BL21(DE3) HUMAN BRAIN TISSUE PLASMID Biological sequence PET28A-AS chem_comp_atom chem_comp_bond database_2 citation citation_author pdbx_entry_details pdbx_nmr_spectrometer repository Initial release Data collection Database references Data collection Database references Structure summary 1 0 2023-02-22 1 1 2024-05-15 1 2 2024-12-11 _database_2.pdbx_DOI _citation.country _citation.journal_abbrev _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.pdbx_database_id_DOI _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.year _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer United States National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) crienstra@wisc.edu 0000-0002-9912-5596 Chad Rienstra principal investigator/group leader kotzbauerp@wustl.edu 0000-0001-7155-114X Paul Kotzbauer principal investigator/group leader STRUCTURE OF ALPHA-SYNUCLEIN FIBRILS DERIVED FROM HUMAN LEWY BODY DEMENTIA TISSUE N RCSB Y RCSB 2023-01-05 REL REL REL N structures with the lowest energy 256 10 isotropic 1 2D CC DARR isotropic 1 2D CC SPC7 isotropic 1 3D NCACX DARR isotropic 1 3D NCOCX DARR isotropic 1 3D CANCO isotropic 2 2D CC DARR isotropic 2 2D NCA isotropic 2 2D NCO isotropic 2 3D NCACX DARR isotropic 2 3D NCOCX DARR isotropic 2 3D NCOCA SPC5 isotropic 2 3D CANCO isotropic 1 2D CC PAR isotropic 1 3D CCC RFDR THEN PAR isotropic 2 3D NCACX PAR isotropic 2 1D C FSREDOR isotropic 1 3D CANH isotropic 1 3D CONH isotropic 1 3D CA[CO]NH RFDR isotropic 1 3D CO[CA]NH RFDR isotropic 1 3D CAN[H]H RFDR isotropic 1 3D CA[HH]NH RFDR isotropic 1 3D N[HH]NH RFDR isotropic 1 4D HN[HH]NH RFDR isotropic 1 2D CACO CTUC-COSY isotropic 2 2D CC FPRFDR isotropic 2 2D CC DARR isotropic 2 2D NCA isotropic 2 2D NCO 66 % 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parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel parallel A GLY 31 A GLY 31 A GLU 35 A GLU 35 C GLY 31 C GLY 31 C GLU 35 C GLU 35 E GLY 31 E GLY 31 E GLU 35 E GLU 35 G GLY 31 G GLY 31 G GLU 35 G GLU 35 I GLY 31 I GLY 31 I GLU 35 I GLU 35 A LEU 38 A LEU 38 A VAL 40 A VAL 40 C LEU 38 C LEU 38 C VAL 40 C VAL 40 E LEU 38 E LEU 38 E VAL 40 E VAL 40 G LEU 38 G LEU 38 G VAL 40 G VAL 40 I LEU 38 I LEU 38 I VAL 40 I VAL 40 A LYS 43 A LYS 43 A LYS 45 A LYS 45 C LYS 43 C LYS 43 C LYS 45 C 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VAL 95 B GLN 99 B GLN 99 B LEU 100 B LEU 100 D GLN 99 D GLN 99 D LEU 100 D LEU 100 F GLN 99 F GLN 99 F LEU 100 F LEU 100 H GLN 99 H GLN 99 H LEU 100 H LEU 100 J GLN 99 J GLN 99 J LEU 100 J LEU 100 1 P 1