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mM Tris 7.5 75 NaCl 1.5 mM MgCl2 1 mM DTT 1 mM BAD 1 mM AMP-PNP 0.025% DDM 7.5 50 mM Tris Tris 75 mM NaCl Sodium Chloride 1.5 mM MgCl2 Magnesium chloride 1 mM DTT Dithiothreitol 1 mM BAD Benzamide adenine nucleotide 1 mM AMP-PNP Adenosine-5'-[(ss,?)-imido]triphosphate Tetralithium Salt; Adenylyl-imidodiphosphate 0.025 % DDM n-Dodecyl-Beta-D-maltoside 1 PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION 1 RNA Vault with BAD bound (MVP/TEP1 sample) 0 RECOMBINANT COMPLEX NO 9606 Homo sapiens 9606 Homo sapiens 293F PARTICLE 1 1 SINGLE PARTICLE 50 FEI FALCON IV (4k x 4k) 300 FIELD EMISSION GUN FLOOD BEAM TFS KRIOS BRIGHT FIELD 2200 900 1 11EQ D39 PARTICLE SELECTION 1 cryoSPARC IMAGE ACQUISITION 1 1 MASKING 1 1 1 CTF CORRECTION 1 LAYERLINE INDEXING 1 1 1 DIFFRACTION INDEXING 1 1 1 MODEL FITTING 1 1 OTHER 1 1 1 MODEL REFINEMENT 1 PHENIX 1.21.2_5419 MODEL REFINEMENT 1 ISOLDE INITIAL EULER ASSIGNMENT 1 FINAL EULER ASSIGNMENT 1 CLASSIFICATION 1 RECONSTRUCTION 1 cryoSPARC 4 NO NO NO YES ETHANE 11EQ 99452.766 Major vault protein 78 man polymer 662.437 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) 78 syn non-polymer MVP,Lung resistance-related protein no no MATEEFIIRIPPYHYIHVLDQNSNVSRVEVGPKTYIRQDNERVLFAPMRMVTVPPRHYCTVANPVSRDAQGLVLFDVTGQ VRLRHADLEIRLAQDPFPLYPGEVLEKDITPLQVVLPNTALHLKALLDFEDKDGDKVVAGDEWLFEGPGTYIPRKEVEVV EIIQATIIRQNQALRLRARKECWDRDGKERVTGEEWLVTTVGAYLPAVFEEVLDLVDAVILTEKTALHLRARRNFRDFRG VSRRTGEEWLVTVQDTEAHVPDVHEEVLGVVPITTLGPHNYCVILDPVGPDGKNQLGQKRVVKGEKSFFLQPGEQLEQGI QDVYVLSEQQGLLLRALQPLEEGEDEEKVSHQAGDHWLIRGPLEYVPSAKVEVVEERQAIPLDENEGIYVQDVKTGKVRA VIGSTYMLTQDEVLWEKELPPGVEELLNKGQDPLADRGEKDTAKSLQPLAPRNKTRVVSYRVPHNAAVQVYDYREKRARV VFGPELVSLGPEEQFTVLSLSAGRPKRPHARRALCLLLGPDFFTDVITIETADHARLQLQLAYNWHFEVNDRKDPQETAK LFSVPDFVGDACKAIASRVRGAVASVTFDDFHKNSARIIRTAVFGFETSEAKGPDGMALPRPRDQAVFPQNGLVVSSVDV 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TAKAEAESRAEAARIEGEGSVLQAKLKAQALAIETEAELQRVQKVRELELVYARAQLELEVSKAQQLAEVEVKKFKQMTE AIGPSTIRDLAVAGPEMQVKLLQSLGLKSTLITDGSTPINLFNTAFGLLGMGPEGQPLGRRVASGPSPGEGISPQSAQAP QAPGDNHVVPVLR A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,u,v,w,x,y,z,1,2,3,4,5,6,7,8,9,0,AA,AB,AC,AD,AE,AF,AG,AH,AI,AJ,AK,AL,AM,AN,AO,AP polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n human human sample 1 893 MVP, LRP 9606 Homo sapiens 293F 9606 Homo sapiens Biological sequence repository Initial release repository Initial release repository Initial release repository Initial release repository Initial release repository Initial release repository Initial release repository Initial release repository Initial release 1 0 2026-05-20 1 0 2026-05-20 1 0 1 2026-05-20 1 0 2026-05-20 1 0 1 2026-05-20 1 0 2 2026-05-20 1 0 2026-05-20 1 0 1 2026-05-20 1 0 2026-05-20 United States Howard Hughes Medical Institute (HHMI) United States Welch Foundation I-1911 United States National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) DP2GM137419 United States National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) R35GM158265 United States Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT) RR150033 vincent.tagliabracci@utsouthwestern.edu 0000-0002-9735-4678 Vincent Tagliabracci S principal investigator/group leader RNA Vault with BAD bound (MVP/TEP1 sample) N RCSB N RCSB 2026-02-19 REL DQV DQV SUBJECT OF INVESTIGATION DQV [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5S)-5-(3-carbamoylphenyl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) Y N DQV 2001 2 DQV DQV 2001 A DQV 2001 2 DQV DQV 2001 B DQV 2001 2 DQV DQV 2001 C DQV 2001 2 DQV DQV 2001 D DQV 2001 2 DQV DQV 2001 E DQV 2001 2 DQV DQV 2001 F DQV 2001 2 DQV DQV 2001 G DQV 2001 2 DQV DQV 2001 H DQV 2001 2 DQV DQV 2001 I DQV 2001 2 DQV DQV 2001 J DQV 2001 2 DQV DQV 2001 K DQV 2001 2 DQV DQV 2001 L DQV 2001 2 DQV DQV 2001 M DQV 2001 2 DQV DQV 2001 N DQV 2001 2 DQV DQV 2001 O DQV 2001 2 DQV DQV 2001 P DQV 2001 2 DQV DQV 2001 Q DQV 2001 2 DQV DQV 2001 R DQV 2001 2 DQV DQV 2001 S DQV 2001 2 DQV DQV 2001 T DQV 2001 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anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel 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anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel A ILE 7 A ILE 7 A ILE 10 A ILE 10 A LYS 33 A LYS 33 A ILE 36 A ILE 36 A VAL 25 A VAL 25 A VAL 30 A VAL 30 A HIS 14 A HIS 14 A ASP 20 A ASP 20 A GLU 41 A GLU 41 A VAL 43 A VAL 43 A VAL 25 A VAL 25 A VAL 30 A VAL 30 A HIS 14 A HIS 14 A ASP 20 A ASP 20 A MET 48 A MET 48 A ARG 49 A ARG 49 A VAL 51 A VAL 51 A VAL 53 A VAL 53 A GLN 94 A GLN 94 A PHE 97 A PHE 97 A GLU 89 A GLU 89 A ARG 91 A ARG 91 A HIS 57 A HIS 57 A VAL 61 A VAL 61 A LEU 105 A LEU 105 A PRO 111 A PRO 111 A VAL 114 A VAL 114 A VAL 115 A VAL 115 A GLY 149 A GLY 149 A THR 150 A THR 150 A GLU 142 A GLU 142 A GLU 146 A GLU 146 A THR 119 A THR 119 A ALA 125 A 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