REL PDBe PDBe PDBe 2012-10-08 2012-10-24 2012-11-28 2012-12-12 Bai XC Martin TG Scheres SHW Dietz H DNA-templated design, Synthetic biology, 3D DNA origami Bai XC Martin TG Scheres SH Dietz H PROC.NAT.ACAD.SCI.USA 109 20012 20017 2012 23169645 doi:10.1073/pnas.1215713109 4v5x FULLOVERLAP A pointer-shaped 3D DNA-origami object, for convenience termed "pointer" A pointer-shaped 3D DNA-origami object, for convenience termed "pointer"

A highly pure and monodisperse sample was obtained in a one-pot overnight reaction, followed by molecular weight cut-off filtration (with 100kDa filters)

monomer 164 4.8 4.8 Calculation M13 phage genome Enterobacteria phage M13 M13 phage 2.4 2.4

isolated M13 phage genome

TGATAGACGGTTTTTCGCCCTTTGACGTTGGAGTCCACGTTCTTTAATAGTGGACTCTTGTTCCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATCTCGGGCTATTCTTTTGATTTATAAGGGATTTTGCCGATTTCGGAACCACCATCAAACAGGATTTTCGCCTGCTGGGGCAAACCAGCGTGGACCGCTTGCTGCAACTCTCTCAGGGCCAGGCGGTGAAGGGCAATCAGCTGTTGCCCGTCTCACTGGTGAAAAGAAAAACCACCCTGGCGCCCAATACGCAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTTGGCCGATTCATTAATGCAGCTGGCACGACAGGTTTCCCGACTGGAAAGCGGGCAGTGAGCGCAACGCAATTAATGTGAGTTAGCTCACTCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGACCATGATTACGAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTCCCAACAGTTGCGCAGCCTGAATGGCGAATGGCGCTTTGCCTGGTTTCCGGCACCAGAAGCGGTGCCGGAAAGCTGGCTGGAGTGCGATCTTCCTGAGGCCGATACTGTCGTCGTCCCCTCAAACTGGCAGATGCACGGTTACGATGCGCCCATCTACACCAACGTGACCTATCCCATTACGGTCAATCCGCCGTTTGTTCCCACGGAGAATCCGACGGGTTGTTACTCGCTCACATTTAATGTTGATGAAAGCTGGCTACAGGAAGGCCAGACGCGAATTATTTTTGATGGCGTTCCTATTGGTTAAAAAATGAGCTGATTTAACAAAAATTTAATGCGAATTTTAACAAAATATTAACGTTTACAATTTAAATATTTGCTTATACAATCTTCCTGTTTTTGGGGCTTTTCTGATTATCAACCGGGGTACATATGATTGACATGCTAGTTTTACGATTACCGTTCATCGATTCTCTTGTTTGCTCCAGACTCTCAGGCAATGACCTGATAGCCTTTGTAGATCTCTCAAAAATAGCTACCCTCTCCGGCATTAATTTATCAGCTAGAACGGTTGAATATCATATTGATGGTGATTTGACTGTCTCCGGCCTTTCTCACCCTTTTGAATCTTTACCTACACATTACTCAGGCATTGCATTTAAAATATATGAGGGTTCTAAAAATTTTTATCCTTGCGTTGAAATAAAGGCTTCTCCCGCAAAAGTATTACAGGGTCATAATGTTTTTGGTACAACCGATTTAGCTTTATGCTCTGAGGCTTTATTGCTTAATTTTGCTAATTCTTTGCCTTGCCTGTATGATTTATTGGATGTTAATGCTACTACTATTAGTAGAATTGATGCCACCTTTTCAGCTCGCGCCCCAAATGAAAATATAGCTAAACAGGTTATTGACCATTTGCGAAATGTATCTAATGGTCAAACTAAATCTACTCGTTCGCAGAATTGGGAATCAACTGTTATATGGAATGAAACTTCCAGACACCGTACTTTAGTTGCATATTTAAAACATGTTGAGCTACAGCATTATATTCAGCAATTAAGCTCTAAGCCATCCGCAAAAATGACCTCTTATCAAAAGGAGCAATTAAAGGTACTCTCTAATCCTGACCTGTTGGAGTTTGCTTCCGGTCTGGTTCGCTTTGAAGCTCGAATTAAAACGCGATATTTGAAGTCTTTCGGGCTTCCTCTTAATCTTTTTGATGCAATCCGCTTTGCTTCTGACTATAATAGTCAGGGTAAAGACCTGATTTTTGATTTATGGTCATTCTCGTTTTCTGAACTGTTTAAAGCATTTGAGGGGGATTCAATGAATATTTATGACGATTCCGCAGTATTGGACGCTATCCAGTCTAAACATTTTACTATTACCCCCTCTGGCAAAACTTCTTTTGCAAAAGCCTCTCGCTATTTTGGTTTTTATCGTCGTCTGGTAAACGAGGGTTATGATAGTGTTGCTCTTACTATGCCTCGTAATTCCTTTTGGCGTTATGTATCTGCATTAGTTGAATGTGGTATTCCTAAATCTCAACTGATGAATCTTTCTACCTGTAATAATGTTGTTCCGTTAGTTCGTTTTATTAACGTAGATTTTTCTTCCCAACGTCCTGACTGGTATAATGAGCCAGTTCTTAAAATCGCATAAGGTAATTCACAATGATTAAAGTTGAAATTAAACCATCTCAAGCCCAATTTACTACTCGTTCTGGTGTTTCTCGTCAGGGCAAGCCTTATTCACTGAATGAGCAGCTTTGTTACGTTGATTTGGGTAATGAATATCCGGTTCTTGTCAAGATTACTCTTGATGAAGGTCAGCCAGCCTATGCGCCTGGTCTGTACACCGTTCATCTGTCCTCTTTCAAAGTTGGTCAGTTCGGTTCCCTTATGATTGACCGTCTGCGCCTCGTTCCGGCTAAGTAACATGGAGCAGGTCGCGGATTTCGACACAATTTATCAGGCGATGATACAAATCTCCGTTGTACTTTGTTTCGCGCTTGGTATAATCGCTGGGGGTCAAAGATGAGTGTTTTAGTGTATTCTTTTGCCTCTTTCGTTTTAGGTTGGTGCCTTCGTAGTGGCATTACGTATTTTACCCGTTTAATGGAAACTTCCTCATGAAAAAGTCTTTAGTCCTCAAAGCCTCTGTAGCCGTTGCTACCCTCGTTCCGATGCTGTCTTTCGCTGCTGAGGGTGACGATCCCGCAAAAGCGGCCTTTAACTCCCTGCAAGCCTCAGCGACCGAATATATCGGTTATGCGTGGGCGATGGTTGTTGTCATTGTCGGCGCAACTATCGGTATCAAGCTGTTTAAGAAATTCACCTCGAAAGCAAGCTGATAAACCGATACAATTAAAGGCTCCTTTTGGAGCCTTTTTTTTGGAGATTTTCAACGTGAAAAAATTATTATTCGCAATTCCTTTAGTTGTTCCTTTCTATTCTCACTCCGCTGAAACTGTTGAAAGTTGTTTAGCAAAATCCCATACAGAAAATTCATTTACTAACGTCTGGAAAGACGACAAAACTTTAGATCGTTACGCTAACTATGAGGGCTGTCTGTGGAATGCTACAGGCGTTGTAGTTTGTACTGGTGACGAAACTCAGTGTTACGGTACATGGGTTCCTATTGGGCTTGCTATCCCTGAAAATGAGGGTGGTGGCTCTGAGGGTGGCGGTTCTGAGGGTGGCGGTTCTGAGGGTGGCGGTACTAAACCTCCTGAGTACGGTGATACACCTATTCCGGGCTATACTTATATCAACCCTCTCGACGGCACTTATCCGCCTGGTACTGAGCAAAACCCCGCTAATCCTAATCCTTCTCTTGAGGAGTCTCAGCCTCTTAATACTTTCATGTTTCAGAATAATAGGTTCCGAAATAGGCAGGGGGCATTAACTGTTTATACGGGCACTGTTACTCAAGGCACTGACCCCGTTAAAACTTATTACCAGTACACTCCTGTATCATCAAAAGCCATGTATGACGCTTACTGGAACGGTAAATTCAGAGACTGCGCTTTCCATTCTGGCTTTAATGAGGATTTATTTGTTTGTGAATATCAAGGCCAATCGTCTGACCTGCCTCAACCTCCTGTCAATGCTGGCGGCGGCTCTGGTGGTGGTTCTGGTGGCGGCTCTGAGGGTGGTGGCTCTGAGGGTGGCGGTTCTGAGGGTGGCGGCTCTGAGGGAGGCGGTTCCGGTGGTGGCTCTGGTTCCGGTGATTTTGATTATGAAAAGATGGCAAACGCTAATAAGGGGGCTATGACCGAAAATGCCGATGAAAACGCGCTACAGTCTGACGCTAAAGGCAAACTTGATTCTGTCGCTACTGATTACGGTGCTGCTATCGATGGTTTCATTGGTGACGTTTCCGGCCTTGCTAATGGTAATGGTGCTACTGGTGATTTTGCTGGCTCTAATTCCCAAATGGCTCAAGTCGGTGACGGTGATAATTCACCTTTAATGAATAATTTCCGTCAATATTTACCTTCCCTCCCTCAATCGGTTGAATGTCGCCCTTTTGTCTTTGGCGCTGGTAAACCATATGAATTTTCTATTGATTGTGACAAAATAAACTTATTCCGTGGTGTCTTTGCGTTTCTTTTATATGTTGCCACCTTTATGTATGTATTTTCTACGTTTGCTAACATACTGCGTAATAAGGAGTCTTAATCATGCCAGTTCTTTTGGGTATTCCGTTATTATTGCGTTTCCTCGGTTTCCTTCTGGTAACTTTGTTCGGCTATCTGCTTACTTTTCTTAAAAAGGGCTTCGGTAAGATAGCTATTGCTATTTCATTGTTTCTTGCTCTTATTATTGGGCTTAACTCAATTCTTGTGGGTTATCTCTCTGATATTAGCGCTCAATTACCCTCTGACTTTGTTCAGGGTGTTCAGTTAATTCTCCCGTCTAATGCGCTTCCCTGTTTTTATGTTATTCTCTCTGTAAAGGCTGCTATTTTCATTTTTGACGTTAAACAAAAAATCGTTTCTTATTTGGATTGGGATAAATAATATGGCTGTTTATTTTGTAACTGGCAAATTAGGCTCTGGAAAGACGCTCGTTAGCGTTGGTAAGATTCAGGATAAAATTGTAGCTGGGTGCAAAATAGCAACTAATCTTGATTTAAGGCTTCAAAACCTCCCGCAAGTCGGGAGGTTCGCTAAAACGCCTCGCGTTCTTAGAATACCGGATAAGCCTTCTATATCTGATTTGCTTGCTATTGGGCGCGGTAATGATTCCTACGATGAAAATAAAAACGGCTTGCTTGTTCTCGATGAGTGCGGTACTTGGTTTAATACCCGTTCTTGGAATGATAAGGAAAGACAGCCGATTATTGATTGGTTTCTACATGCTCGTAAATTAGGATGGGATATTATTTTTCTTGTTCAGGACTTATCTATTGTTGATAAACAGGCGCGTTCTGCATTAGCTGAACATGTTGTTTATTGTCGTCGTCTGGACAGAATTACTTTACCTTTTGTCGGTACTTTATATTCTCTTATTACTGGCTCGAAAATGCCTCTGCCTAAATTACATGTTGGCGTTGTTAAATATGGCGATTCTCAATTAAGCCCTACTGTTGAGCGTTGGCTTTATACTGGTAAGAATTTGTATAACGCATATGATACTAAACAGGCTTTTTCTAGTAATTATGATTCCGGTGTTTATTCTTATTTAACGCCTTATTTATCACACGGTCGGTATTTCAAACCATTAAATTTAGGTCAGAAGATGAAATTAACTAAAATATATTTGAAAAAGTTTTCTCGCGTTCTTTGTCTTGCGATTGGATTTGCATCAGCATTTACATATAGTTATATAACCCAACCTAAGCCGGAGGTTAAAAAGGTAGTCTCTCAGACCTATGATTTTGATAAATTCACTATTGACTCTTCTCAGCGTCTTAATCTAAGCTATCGCTATGTTTTCAAGGATTCTAAGGGAAAATTAATTAATAGCGACGATTTACAGAAGCAAGGTTATTCACTCACATATATTGATTTATGTACTGTTTCCATTAAAAAAGGTAATTCAAATGAAATTGTTAAATGTAATTAATTTTGTTTTCTTGATGTTTGTTTCATCATCTTCTTTTGCTCAGGTAATTGAAATGAATAATTCGCCTCTGCGCGATTTTGTAACTTGGTATTCAAAGCAATCAGGCGAATCCGTTATTGTTTCTCCCGATGTAAAAGGTACTGTTACTGTATATTCATCTGACGTTAAACCTGAAAATCTACGCAATTTCTTTATTTCTGTTTTACGTGCAAATAATTTTGATATGGTAGGTTCTAACCCTTCCATTATTCAGAAGTATAATCCAAACAATCAGGATTATATTGATGAATTGCCATCATCTGATAATCAGGAATATGATGATAATTCCGCTCCTTCTGGTGGTTTCTTTGTTCCGCAAAATGATAATGTTACTCAAACTTTTAAAATTAATAACGTTCGGGCAAAGGATTTAATACGAGTTGTCGAATTGTTTGTAAAGTCTAATACTTCTAAATCCTCAAATGTATTATCTATTGACGGCTCTAATCTATTAGTTGTTAGTGCTCCTAAAGATATTTTAGATAACCTTCCTCAATTCCTTTCAACTGTTGATTTGCCAACTGACCAGATATTGATTGAGGGTTTGATATTTGAGGTTCAGCAAGGTGATGCTTTAGATTTTTCATTTGCTGCTGGCTCTCAGCGTGGCACTGTTGCAGGCGGTGTTAATACTGACCGCCTCACCTCTGTTTTATCTTCTGCTGGTGGTTCGTTCGGTATTTTTAATGGCGATGTTTTAGGGCTATCAGTTCGCGCATTAAAGACTAATAGCCATTCAAAAATATTGTCTGTGCCACGTATTCTTACGCTTTCAGGTCAGAAGGGTTCTATCTCTGTTGGCCAGAATGTCCCTTTTATTACTGGTCGTGTGACTGGTGAATCTGCCAATGTAAATAATCCATTTCAGACGATTGAGCGTCAAAATGTAGGTATTTCCATGAGCGTTTTTCCTGTTGCAATGGCTGGCGGTAATATTGTTCTGGATATTACCAGCAAGGCCGATAGTTTGAGTTCTTCTACTCAGGCAAGTGATGTTATTACTAATCAAAGAAGTATTGCTACAACGGTTAATTTGCGTGATGGACAGACTCTTTTACTCGGTGGCCTCACTGATTATAAAAACACTTCTCAGGATTCTGGCGTACCGTTCCTGTCTAAAATCCCTTTAATCGGCCTCCTGTTTAGCTCCCGCTCTGATTCTAACGAGGAAAGCACGTTATACGTGCTCGTCAAAGCAACCATAGTACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGACCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCGCCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTTTAGGGTTCCGATTTAGTGCTTTACGGCACCTCGACCCCAAAAAACTTGATTTGGGTGATGGTTCACGTAGTGGGCCATCGCCC DNA SINGLE STRANDED false synthetic DNA segments synthetic construct 2.4 2.4

163 smaller DNA segments with the following sequences: CAAAGGGCGGGTGCCTCGCTCACTGCTTAATGTTGCATGCGGTCACGTTG ATTGTTGTTCCGGCCAACCAGGGTGGTGCCAAGCGACAGGAAGCCGGA TTTTTTTTTTGGGTGAGACGGGCGAGTTTTTTTTTTAAAGGGTCGTGCCGAGGATCCCCGGGTTTTT AGCGAAATCGCCTGGCCCTTGCCCCAGAGTAAAATAACATCACTT AAAATCAGCCCCCGGCAGGCGAAAATCCTGACGCTGGTTGAGAGAGGG GGGCCGTAAAGCACTAAATTTTTTTTTTTCGGAACCGGAAAGCCGGCGATTTTT TTTTTAGCGGTCCTTTTTTTTTTTTTGATGGTGGTTCAATAGCCCTTGGGC TTTTTACGTGGCAACAGCTGAGAAGTTTTCCTTTTTTTTTTCAGTCACGACGTTGT GCGCGCGGGGACGTGCTTCGCCGCTACAGCTTTCAATAGGAATTGCGG AGGCGGTTTTTTTTTTTTTGCGTAGAGTTTTTTTTTTATAGGGTTGAGTAAAGAACTT AACCTAAGGGTTTTTTTTTTAAGAAAGCGAAAGGTCACGCTAGCTCTTTTTTTTTTGAATTCGTAAT GCGTTGAATGAGTGTAAAGTGTAATTGTTAAGGAAGATGATAATCATG AACCCGCCGCGCCCGCTTTAATGAATCAGTTTGGCCTTATAAATCAAA TTTAACTCGCGTCTTTTTTTTTTTGAAATGGATCACCATCAACTGTTTTTTTTTTATAGCAAACAT CAAAACGTTAAAACTAGCTTGAGAGATCTGGAGCTCATTGAATCCCCCTCGAATCG ACTCTAAGCTGCATTCCAGTCGCGTGAACCGTCTATCAGGGCGATGTTTTTTTTTTGCCCACTAGGA TTTTTTACCGGCGCGTAAACAACCCGAAATTTTTTAAAAATTCTGAGT CAGTGTAGCGGAGCGGGCGCTAGGGCGAAAAACCAACAAGAGTCCACT ATTTTATCCTCGTTCGTGCATCTGGTGTAGCACCAGCACTCAGAGCAA TTTTTAACCAGAGGAATTTTTTTTTTAAACGCTCCATCACCTCATTAG GAGTAGAAGGTTGGGTAACGCCTTTTTTTTTTAGGGTGTTTTTATCCA TCTTTGATTAGTAAGAGTCTGTGGGCGATCCCAGGCAACAATAACCCA GCTGGCAGCTTTCGCGCGAGCAACACCGCTCCTGATTTAGAACCTGA ATTACGAATCAGTGCAGAATCCTGATTGCCTTCACCAGGTCGAGGTATCACCCAAATCAAGTTTTTT TTTTTGCAACGCTAGTTTGACATATCTTTTTTTTTTTGGTCAGTTGGCACCG GCGATTAATAGCTCAACTGGAAGTCTTTTGATCTATTATACCATCCTAGTCCTG GCTGGTAATATCCGAATTGAGCCAATTCTAGGTCAGGAAAAAGATGC ATCGGCCGGCGGATTCAGTATTGGCAAAGAGATGATGATTAACAATAA GACTTCTGGTCGGTACGCAGGCCACCATTTAGAGCTTGACGGCTAAAG CCAGTTCTGAGAGCTGTTTAGCATTGCATCATTAGAGAAA GCCGAAAGGGTACGGTGTCATGTTTTGCGGATGGCTTAGAGCTT AAGGTGCGGGGTTGATTCGAAGGTTACTTTAGGAGCACTAACGTTTTA TTAGGAGGCCCAAATTAACCGTTTTTTTTTTTTGCAGCCATTTTTTT AATGTGATGGGATACTGCAGGTACGGCCAGTTTTTCTTCTTCACCGGC CAACATAATAAAGCGAAGATAATTGCACGTGATGATGGCATCGGAAGT GCCAGGGCGCCGGAAGCAAGCTAACTTTTTTTTTTTCACATTAAGTGTTTTTTTTTTGACTCCAACGT TTTTTTCAATCGTTGTACCAACCTAATTTTTTTTTTAACATCGCCATTAAGATTTTCGAGCGG GTTGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAAGCCTGTTTTAACCAT TATAAGCAAAAGGGGAAGCCTTTTTTTAATATTTCAATCATATGCGGG ACAAAATAATATACGAGCGTACTATGGTTTTTTTTTTTTGCTTTTGACGCTTTTT CCATCACCAAAAACTCCGCTCACAATTCCACACTTTTTTT GGCCAACAGATACGTGGTAATGCCGGGGAAGAAGG CGATTAGTCTTTAATTTTTTTTTTTGCGCGAATATGATAACGGAACTGACGAGAAACACCAGTCAATA CTATTTATGTCAATCCCTTCTGAAACAAGAGAATCGATCCTGAG ATAAATCACAGACACCACATTCAACTAATGAT TTTTTGGTCATTGGAATTTTTTTTTTCGGTAATCGTAATATTTTGTGCAATGCTT AGTCTACAAAAAGAACTGTTGTGAATTACCTTATAGAAATTTTT TTTTTGAATGGCTACCAGTAAATTGGCAGATTCACCATTTTTTTTTTGTCACA TAGAACAATTACATAACAAACAATCATAATAGTACCGACAAAA GATGAGAAAGGTAAATTGAAATCTACAAAAGAAGAGCAACACTATCAT TATGTGAGTGAAGTTACAAGCCAACGATTTAACATAAATTGTAA AATTATTTTTTTTTTAAATTCGCATTTCGGATTCACAGGCAATAGCATTAGG AATTTAATCAGCTCATTAAATGTTTAATAAATATAAAGGAAT TTTTTTAAATCATTCCTTTTTTTTTTGTGGGAACAAACTCAGGAAAATAGTAGTGAAAA GGTACCCTGAAAGAGGTCTAAACCAATTATTTTTTTTTTAATCAAGAT AATGGTAGCGCCATATCGTAACAGAATCAGCACGTATAAG ATAGACTTCAACCAGACCACCGCGCCTCCGGTATCTAACGAGCGTCT GCAACATGAGGCGGTGACCGTAAGCGAGTACCACCA GCAGCAGATTATCAAAAACAGATAGGCAGATTATACAAGACCTAAACTATATGTATCAATAG CAAATATTTTTTTTTTTTTCAAACCCTCAATCATGCTGAACACCAGAAGAGGTTTAAAT GAAAGAGAACAATGTTGGGAACCATCACGGATTAAAGTTGCAGCATTTTT ATTTTTTTTTTTTTAAATATGCTTTTTTTTTTAACTAAAGGGATTTTTTTTTTTGTGCTGCAAG TTGCTCTTCATTCCCATTTGGGCGGCACCGCGACGACAGTAAAACGCG TCAATAGATAATAAAGGCTTACAATAGCAGCGAATAAACAGCTTGATAATAAGTA TTTGAGTCGAGCTTCAAAGCGAAATATCGCCTGAGGCTACTAAAGAAG AACTTTTTTTTTTAATTCGACAACTTTTAAAACATCGC ATCAAAGCGGTATATTTTATATAACACCTCTTCGCTATCGGCCTTGCCT AACTTTGAGGTGCAGGGATTTCTTAATAATTTTTAAAGTCAGATTTAT TTTTTAAAATCAGGTCTTTGGCATCATTTTTTTTTTATTCTACTGATTTTTTTTTTTCGCACTCCA CCCGAAACATTTCGGTAGATTTGCGCAACTATTACCGCTAGCAATACT CGAACGTTATTAATCGTATTATAAACAACTGAATTTTGTCGTCTTTCCAGACG GTTTTTTTTTTTTTGAGTAACATTTACCTTTTGAGGCG TTATTCGGAAACAGTTAGATTAAGACGCTGTTATATAATTTAATGGGG AAGGGTGTTTGGATATAGATAAATTTACGAGCATGTTTTTTTTTTTAGAAACCAATCAACGGGTAT CATATCCAAAAGAAATTAGCAACGCAAGGAGTTAAATCTAAATT AGATCATTTTTTTCCATTACGCATAACGACAATGTAGAAAGGAG ACATTTTTTTTTTTCGGGAGAAACTCATTACCGTAATCTTGACAAGAACTGACCTTGTACAG CTTGAGATGGTTTAAATTACCTTATTTCAAAATTAAGCTA TTTTTACGAGACAAAATTCCTCATATTTTTTTTTTTATTTTA AAAACGAGTAGCCGGAGAGTTCTAGCGAAAAGCCTAAAAGGGACATTCT TATGACCCTGAAATCGGTCTGGCCTTACCTACATTTGACGAGAGCGGGAGCTATTTTT TAACCTTCCCTTAGAATCCTTGCCAATCGCATATTTTAAGTACC AATCGTCCGGATATAATAACGGACTGACCAGACGGTCAGTTACT CAATTTTTTTTTTATCAACGTAACAAAGCTGCTCATTCAGTA CTTTAAACTTTTTTTTTTAGTTCGCGATTTTGGCTATCATTTTT ACGCCAACCTGAAAGCGTAAGAAGATAGAACATATGTACCCCGGTTTG TTTTTAGGTAGAAAGATTCATCAGTACCAGACGACGATTTTTTTTTTTAAAAAC CAAAATAGCGAGAGGCTTTTGCGTTAATAATAGGAATAATA TCGACTGGATAGCGTCCATTTTTTTTTTATACTGCGAAATG TACGAGGCCAGATACAAGGACGTTGAGAGGGTTAAAGATTCAAATATTAGCTCATTGCTGGC AGTAAGTTTTGCCAGAGGGGGTAATAGTAATACCAGTCTA AACCCTCGTTTTGAGATTAACGAACTATTCAACCCAGTCAAATTATTT TTTATCAAAATCATAGGTCTTTTTTTTTTTGAGAGACTACCTATAAGG GTTTTAGTATTACCTGAGAAAATTATAACAGAGGGTGCCACGTGAGGG AACATACAGTATAAAAATCGCGAATTGCGTAAAATACCATCTAAAGATGGAAATTCGCCA TAATTTTGCTTCTGTGAATAAGGCTTGCCCAACATTATTACTTTTT GAACGCGATAGGCTGGCGCTATTAGGAACCGAATTCGCCTGAATATACAGTAAC CGAACGCAATAAGTTACCTTTGGGAATTAGAGCCTTAGCGTTTGCCATTTTT CGAAAGCCTGCAATAGTGTTCATTTGATTTCAACTGTGTAGGAG ACTGATATAAGTATATTTTTTTTTTGCCCGGAATAGGTAGGCTGAGTTTTT GATCAAGAAAAATGATTTTTTTTTTCCATATGAATAATACATCCAATTTTT ATATAATACTAGAATGTGATAATTTTAACCCAAAGACAAAATTTTTTTTTTGGGACCGACTTGAGTTTTT CATTTTAAAGTACACAGCGATTCCCATGTATACCGAAGCCCTTTTTGA GTAATTAATAAAGACAGAGGCGATAAAGCTTAATACTTCG CGCCATCTCAACAGTTTCAAATAAGACAAAAAGACACCACGGAATAAT CAACTTTGAAAGAGGTTTTTTTTTTACAGATGAACGGTCATCAAGA GGTAAAGTAATTCGCTAATGCAGAACGCGCCTTTTTTTTTTTGTTTATCAACATATACTTCAATCATTTTT TAACGAAGGCACAGCCCTCATAGTTTTTTTTTTTTAGCCCCACAAG GAATACGTACAAACAGCAAGAAACAATGAACCCTGAACTCACGTTGTA AGGCAAGTCGAAATGAGGTTTAGCGGATAATAGCGGGGGAAACGCA AACGAACTTTTTCAAATTGAGACGTCAGATGATTGCTTTGAATACCAA AACATGTTCATGTCCAGACTCATTTTAATAACGGTCACCGTCCGACATTC CACCCTGTATCGGTAGGCTCCATTAGACGGTGTTTAACGTCAAAAATG GGGATCCGAGGGTATTGACCCCACGGAGATCCCTCA TTTAAGAGGAATATTCCTAATGAAAAGAACGAACATGGGCGCCCTGTA GATATAGATTTTGCAATCCTTTGATTTAGAAGTATTAGACTTTACATTAGTA CCAAACGGGTAAAATTTTTTTTTTTACGTAATGCCACTGCCGGAAC GGTGAAGTTAAAGGGAATCATTGGAAGCAAGATTAGAGAATCAACAGTT GCGTACCTTTTGAAATATTCTAAATATAATGCTGAACTCAAACT GCCGTTGAACCTCCCAGCTACAATTTTATCCGATTTTTGAGAATTAAC GAAGCCGTACCGCATTCCAAGAATAATCGGTAAGCAGATAGCCTTTTT GCTTTATTTTCAAAAAAATTATCAGCAGCTATCTCCGTAACACTGAGT AATTTCAACAGTTTCTTTTTTTTTTAGCGGAGTGAGAAACAACAAC TAGCAGCCTTTACAGTTTTTTTTTTAGAGAATAACATA CCAACGTCTAAGAACGCGAGGCAACTAATAACTCCAACGCGAACGACA TTCGCCATATTAGGGTAATTGAGCGCTTAAGCCCAATACCGATAA AAAATAGTTGCTATCCTTATCACTCATCGAATAATATCGTCAGAAGCAATATAACT CCCAATCCAAATAAGAAACTGAATCTAAAATCTCCATCGTAGCCGCTT CACAGAGCCTAAGGAATTAGCAAATCTTCGGTCGGTTTTAATAAGAAACCCT AAAACAGGAAGAAAAGCTGTCTTTATAAACAACAAGAAAATAATAAGAAC AGCGCAAAAGGAGCTTTGCACCCGACTTGCGGGAGGTTTTAATTGCAA TGAACAATAGCAATTTGCTTTCACTCATCTGCAACGGCAT AGATAAGTAACTTTTTTTTTTGATCTAAAGTTTTAGTTACAAAATAAA AATTGAGTAATATCAGAACAACTAAATTTGCCCTGTATGGAGATATAGCA TTTTTGAACACAGGGATAGCAAGCCCCCACCACCCGACGACAACCGAC TTAACCGCCATTGTATCACATCTTCTATTCTTACGCGATAGCTACATA CAACGCCTGTAGCAGTACTCAGCCGCGACCGAAAACTTTAGGGCTTAT GATAAGACTCATAGACGGATATTCATGAGCCGCCGCCAGCATCGCCTC CATGATACCGCCACGCACCATTACCATTAGTTTCATCGTAAACAGTGT AGGTACCGCCACCAATGAAACCATCGAAGTTTGCCCTATT GCCGTCGAGAGGGTCAGGCGCATGCTCCATATCATAAGTGAGGAAGGCGGAACAGCC TTTTTACTCCTCAATTTTTTTTTTTTAAGCAGTAGCGACAGAATCATAGCAGCATTAGGATGT TTTTTCCAAGAAGGAATTTTTTTTTTACCGAGGATTAAATAAGAATTTTTTTTTTTAAACACCG ATGTGAATTAAATACCCAACCAGCGCTCCGGCTTAGGTTGGGAGAAGA TACCTCAGAGAATAGGAAATACCAAGCTTTAATTCAGCAGCGGAACAA GTCAAGGCCGCGTAGAAACTTATTACTTGTCACAAAATGCTGATGCAAATAA TTTTTTCTTTTCATAATCCCTTGATATTTTTTTTTTTTCACAAACAAATA TGCCTATTAGCAAAGAAACGTCACCCTCAGCGTCACCAACTAAAACGA ATGAGTGTACAGAGCCACTTTTTTTTTTCACCCTCAGAGCCG AAGTAGAGAAGGACCGTAATGTATCACCTTCCACAGACCAACCTAGTTGCGCCC GCCTTGTCAGAGCCGCCACCCTCAGAACCGACCAGAACCC AAACGATTGGAAAATCACGGTTGAGGAACCGATTGAGGGAGGTATGGT GAAAGCGCAGTCCGGGGTCATAATGCCCCACCACCAACATAAAGGTGGCA CATACATGGCTTTTTTTTTTTTTTGATGATACAGTCTGAAACATGA CCCCACCCTCTGGTAATAAGTTTTAATCTGAATTTCAGACTGTAGCGC CAGGTCAGACCGGAACTGACAGGACGGAACCACATTAAAGCACCAG CCAGTAACAGGAGCCACCTCCTCATTGGTCATAGCCCCCTTAAGCAAA TTAAAGAACTTTTGAAATCGCGAAACCGAGCCAGAAAGACAGCAATTC AAAATTCAGAAGGTAAAAATTATTTGCCCGTAGCATTTTCAAAGCCAGAATG ACAGTTTATTGCAGTATGGTTAATTTTCGCCTGAACGCCAACTACAGAGGTTATCATCAG ATAAAATTTTGCTCTTTCGGAACTTTAGCGTACCGTTCCAGTAAGCGT

DNA SINGLE STRANDED true singleParticle particle 48 7.6

10 mM TRIS-HCl, 20 mM MgCl2, 5 mM NaCl, 1 mM EDTA

glow-discharged holey carbon grids with an ultrathin carbon film on top (Agar Scientific, catalog no. S187-4)

ETHANE 100 90 FEI VITROBOT MARK III FEI POLARA 300 FLOOD BEAM BRIGHT FIELD FIELD EMISSION GUN 300 2 0.82 4.41 31000.0 39436.0 OTHER 80 90 85 Objective lens astigmatism was corrected at 39,000 times magnification 0 2012-04-01 FEI FALCON I (4k x 4k) 14 283 10

Every image is the average of sixteen frames recorded by the direct electron detector

Particles were manually selected. CTF parameters were estimated using CTFFIND3. An initial model was obtained by DNA origami structure prediction software, and the refinement was performed using the 3D auto-refine option in RELION.

each image

C1 OTHER 11.5 OTHER CTFFIND3, RELION

RELION (= FREALIGN = XMIPP = 3DEM-convention). The final map is a composite map, which consists of maps filtered at different resolutions ranging from 14A at the periphery to 9A at the core of the object. See publication for more details.

28502